1、论文
(1) Chuan-tao Cai, Zhi-quan Cai, Vegetative growth and photosynthesis in coffee plants under different watering and fertilization management managements in Yunnan, SW China. Photosynthetica, 2007, 45(3): 455-461.
(2) Chuan-tao Cai, Jin-song Luo, Yun-zhi Nan, Energy and Economic flow of homegardens in Sub-tropical Yunnan , SW China: A case study on Sanjia village. The International Journal of Sustainable Development and World Ecology, 2004,11(2): 199-204.
(3) Qishi Song, Darong Yang, et al. Volatiles from Ficus hispida and their attractiveness to fig wasps. Journal of Chemical Ecology, 2001, 27(10):1929-1942.
(4) Qishi Song, Chongren Yang, et al. Tsaokoin, a new bicyclic nonane from Amomom tsao-ko. Chinese Chemical Letters, 2001, 12(3): 227-230.
(5) Chun Chen, Qishi Song, Magali Proffit, et al.2009. Private channel: a single unusual compound assures specific pollinator attraction in Ficus semicordata. Functional Ecology, published online first.
(6) Cai ZQ, Schnitzer SA, Bongers F. Seasonal differences in leaf-level physiology give lianas a competitive advantage over trees in a tropical seasonal forest. Oecologia, 2009, 161:25-33.
(7) Cai ZQ, Poorter L, Han Q, Bongers F. Effects of light and nutrients on seedlings of tropical Bauhinia lianas and trees. Tree Physiology, 2008, 28:1277-1285.
(8) Cai ZQ, Poorter L, Cao KF, Bongers F. Seedling growth strategies in Bauhinia species: comparing lianas and trees. Annals of Botany, 2007, 100: 831-838.
(9) 蔡传涛, 蔡志全, 周庆辉等. 田间不同水肥管理下小粒咖啡的生长和光合特性. 应用生态学报, 2004, 15(7): 1207-1212.
(10) 刘贵周, 蔡传涛, 罗 媛等. 两种萝芙木生物量分配与估测模型研究. 云南植物研究, 2009, 31(1): 63-66.
(11) 李宝强, 宋启示. 大叶千斤拔根的化学成分. 中草药, 2009, 40(2): 179-182.
2、专利
(1) 一种春茶栽培方法，国家知识产权局已正式批准，并颁发发明专利证书
(2) 一种咖啡育苗方法，国家知识产权局已正式批准，并颁发发明专利证书
(3) 一种受冻咖啡植株快速恢复方法，国家知识产权局已正式批准，并颁发发明专利证书
(4) 一种春茶栽培方法，国家知识产权局已接受专利受理
(5) 一种受冻茶叶的快速恢复方法，国家知识产权局已接受专利受理
(6) 一种灯台树育苗方法，国家知识产权局已正式批准，并颁发发明专利证书
(7) 一种灯台树种子采集与收藏方法，国家知识产权局已正式批准，并颁发发明专利证书
(8) 一种大叶地不容育苗方法，国家知识产权局已正式批准，并颁发发明专利证书
(9) 一种野生黄藤的人工繁殖方法，国家知识产权局已正式批准，并颁发发明专利证书
(10) 一种人工栽培黄藤植株的持续利用方法，国家知识产权局已正式批准，并颁发发明专利证书
(11) 一种云南黄连的人工栽培及持续利用方法，国家知识产权局已接受专利受理
(12) 一种云南黄连的人工繁殖方法，国家知识产权局已接受专利受理
(13) 一种大叶地不容的人工繁殖方法，国家知识产权局已正式批准，并颁发发明专利证书
(14) 一种催吐萝夫木的人工繁殖方法，国家知识产权局已正式批准，并颁发发明专利证书
3、获奖情况
（1）咖啡优质高产稳产综合配套技术推广应用，2005年思茅市科技进步一等奖。
（2）灯台树植物资源调查与人工繁殖试验示范，2006年云南省科技进步三等奖。
（3）2007年获得2006年度中国科学院与省市、企业合作先进个人二等奖。